Nella modalità storia di Marvel Nemesis: Rise of the Imperfects, ci sono alcuni personaggi che puoi controllare che non sono disponibili nella modalità versus. Per sbloccare questi personaggi, devi completare i tre livelli richiesti, di cui l'ultimo è uno scontro con un boss. Alcuni di questi scontri sbloccano due personaggi contemporaneamente.
Brigade | Sconfiggi Brigade nella terza missione di Iron Man |
Daredevil | Sconfiggi Johnny Ohm nella terza missione di Daredevil |
Fault Zone | Sconfiggi Fault Zone nella terza missione di Storm |
Hazmat | Sconfiggi Hazmat nella terza missione di Magneto |
Human Torch | Sconfiggi Altered Thing nella terza missione di Human Torch |
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