I Marvel Nemesis: Rise of the Imperfects story mode er der visse karakterer, som du kan styre, som ikke er tilgængelige i versus mode. For at låse disse karakterer op, skal du have gennemført de tre påkrævede niveauer, hvoraf det sidste er en boss kamp. Nogle af disse kampe låser to karakterer op på én gang.
Brigade | Besejr Brigade i den tredje Iron Man mission |
Daredevil | Besejr Johnny Ohm i den tredje Daredevil mission |
Fault Zone | Besejr Fault Zone i den tredje Storm mission |
Hazmat | Besejr Hazmat i den tredje Magneto mission |
Human Torch | Besejr Altered Thing i den tredje Human Torch mission |
|